MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 67017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	AG	3	6	44	49	50 %	0 %	50 %	0 %	15826866
2	NC_002677	CGT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826866
3	NC_002677	CAC	2	6	84	89	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826866
4	NC_002677	GTC	2	6	103	108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826866
5	NC_002677	GAC	2	6	136	141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
6	NC_002677	CCA	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826866
7	NC_002677	CTC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15826866
8	NC_002677	CAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826866
9	NC_002677	CAG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
10	NC_002677	ACA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826866
11	NC_002677	GAC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
12	NC_002677	CGA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
13	NC_002677	CGTT	2	8	569	576	0 %	50 %	25 %	25 %	15826866
14	NC_002677	TGC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826866
15	NC_002677	CGC	2	6	699	704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826866
16	NC_002677	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826866
17	NC_002677	TCA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826866
18	NC_002677	GAC	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
19	NC_002677	AAG	2	6	878	883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826866
20	NC_002677	AAG	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826866
21	NC_002677	TTC	2	6	898	903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826866
22	NC_002677	CAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826866
23	NC_002677	TCT	2	6	949	954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826866
24	NC_002677	AAC	2	6	968	973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826866
25	NC_002677	TTA	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826866
26	NC_002677	CAG	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826866
27	NC_002677	TCA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826866
28	NC_002677	CAA	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826866
29	NC_002677	CCG	2	6	1301	1306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826866
30	NC_002677	ACC	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826866
31	NC_002677	GAA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826866
32	NC_002677	ACCAC	2	10	1448	1457	40 %	0 %	0 %	60 %	15826866
33	NC_002677	CAC	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826866
34	NC_002677	CTT	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002677	GT	3	6	1639	1644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002677	CAA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002677	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002677	CAA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002677	TTC	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002677	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002677	ACT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002677	CGT	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002677	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002677	GTTG	2	8	2102	2109	0 %	50 %	50 %	0 %	15826867
45	NC_002677	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826867
46	NC_002677	TGC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826867
47	NC_002677	CTT	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826867
48	NC_002677	GTT	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826867
49	NC_002677	CGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826867
50	NC_002677	GCC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826867
51	NC_002677	TGG	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826867
52	NC_002677	TGTC	2	8	2753	2760	0 %	50 %	25 %	25 %	15826867
53	NC_002677	TAC	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826867
54	NC_002677	CTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826867
55	NC_002677	CCA	2	6	2898	2903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826867
56	NC_002677	TGG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826867
57	NC_002677	GC	3	6	2961	2966	0 %	0 %	50 %	50 %	15826867
58	NC_002677	CCG	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826867
59	NC_002677	GAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826867
60	NC_002677	GCCGA	2	10	3027	3036	20 %	0 %	40 %	40 %	15826867
61	NC_002677	AGA	2	6	3037	3042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826867
62	NC_002677	CTGA	2	8	3098	3105	25 %	25 %	25 %	25 %	15826867
63	NC_002677	TGC	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826867
64	NC_002677	ATG	3	9	3189	3197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826867
65	NC_002677	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826867
66	NC_002677	GGAC	2	8	3350	3357	25 %	0 %	50 %	25 %	15826868
67	NC_002677	CCA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826868
68	NC_002677	GATT	2	8	3526	3533	25 %	50 %	25 %	0 %	15826868
69	NC_002677	TGC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826868
70	NC_002677	GGGC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	75 %	25 %	15826868
71	NC_002677	CGT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826868
72	NC_002677	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826868
73	NC_002677	TGC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826868
74	NC_002677	GC	3	6	3730	3735	0 %	0 %	50 %	50 %	15826868
75	NC_002677	TGC	2	6	3750	3755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826868
76	NC_002677	AGC	2	6	3784	3789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826868
77	NC_002677	AC	3	6	3822	3827	50 %	0 %	0 %	50 %	15826868
78	NC_002677	GTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826868
79	NC_002677	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	15826868
80	NC_002677	GTT	2	6	4213	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826868
81	NC_002677	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826868
82	NC_002677	GAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826868
83	NC_002677	TGC	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826868
84	NC_002677	CAG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826868
85	NC_002677	GCG	2	6	4340	4345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826868
86	NC_002677	AGG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826868
87	NC_002677	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826868
88	NC_002677	GC	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	15826869
89	NC_002677	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826869
90	NC_002677	TGC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826869
91	NC_002677	CGT	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826869
92	NC_002677	AGGGT	2	10	4724	4733	20 %	20 %	60 %	0 %	15826869
93	NC_002677	TGG	2	6	4754	4759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826869
94	NC_002677	CAA	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826869
95	NC_002677	TGC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826869
96	NC_002677	TGGTG	2	10	4902	4911	0 %	40 %	60 %	0 %	15826869
97	NC_002677	CAT	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826869
98	NC_002677	GAG	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002677	CGA	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002677	GTG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002677	CTG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002677	CCA	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826870
103	NC_002677	GTG	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
104	NC_002677	CGA	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826870
105	NC_002677	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826870
106	NC_002677	GGT	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
107	NC_002677	GTG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
108	NC_002677	GT	3	6	5602	5607	0 %	50 %	50 %	0 %	15826870
109	NC_002677	GGT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
110	NC_002677	CCA	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826870
111	NC_002677	GGTCGA	2	12	5633	5644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15826870
112	NC_002677	ACG	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826870
113	NC_002677	GC	3	6	5802	5807	0 %	0 %	50 %	50 %	15826870
114	NC_002677	AAG	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826870
115	NC_002677	TTG	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826870
116	NC_002677	CGA	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826870
117	NC_002677	GTC	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826870
118	NC_002677	GAA	2	6	5937	5942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826870
119	NC_002677	TGG	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
120	NC_002677	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826870
121	NC_002677	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826870
122	NC_002677	GAA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826870
123	NC_002677	GTG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
124	NC_002677	A	6	6	6240	6245	100 %	0 %	0 %	0 %	15826870
125	NC_002677	CGA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826870
126	NC_002677	GGC	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826870
127	NC_002677	TCG	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826870
128	NC_002677	TGG	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
129	NC_002677	TGTA	2	8	6601	6608	25 %	50 %	25 %	0 %	15826870
130	NC_002677	TGG	2	6	6626	6631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826870
131	NC_002677	ATT	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826870
132	NC_002677	ATG	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826870
133	NC_002677	TGT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826870
134	NC_002677	GCC	2	6	6932	6937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826870
135	NC_002677	AGCG	2	8	6990	6997	25 %	0 %	50 %	25 %	15826870
136	NC_002677	TTA	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15826870
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404	NC_002677	GGT	2	6	20665	20670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826879
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408	NC_002677	TGG	2	6	21038	21043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826880
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500	NC_002677	CGGAT	2	10	26009	26018	20 %	20 %	40 %	20 %	15826883

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